#1 Duplicada diría yo

#2 y #5 ya que os veo puestos una preguntita. ¿Como se cuentan lo genes? Es que puedo entender que se cuenten las bases, los cromosomas, etc. pero nunca entendí como se cuentan los genes. Por gen siempre he entendido una secuencia de ADN que contiene la información necesaria para la creacción de una proteina, en resumen, una secuencia funcional. Vamos, que la secuncia puede ser de un par hasta de miles de pares de bases. Es decir, creo que para contar genes se ha de saber el funcionamiento de todo el genoma, para que sirve y que proteinas codifica y hasta donde sé esto aún no lo sabemos. ¿En que me equivoco? Gracias por la aclaración.

#13 No soy uno de esos pero intentaré responder... me imagino que entiendes algo de esto

Hay programas que anotan el genoma (Ven dónde están los genes), en procariotas es bastante sencillo, si encuentran un ORF (Marco de lectura abierto, donde habría un codon de inicio de una proteína) que dura más de x aminoácidos, con una secuencia parecida a un promotor y tal pone que es un gen, suelen acertar bastante.

En eucariotas es bastante más complicado pero hay algoritnmos que se basan en 3 cosas:
- Estadísticos: La zona de inicio tiene un 40% de adeninas (me lo estoy inventando), pues va multiplicando probabilidades (Así explicado sencillo) y ve si es probable que sea la zona de inicio de un gen o no.
- Detectar zonas conservadas, que las hay pero menos conservadas que en procariotas.
- Homología con otras secuencias: Compara organismos similares y si hay un gen en una en la otra deberá haberlo. Esto es lo que mejor funciona.

Estos programas no son demasiado buenos y anotan bien solo el 70%-80% de los genes (Aprox), luego se va comprobando a mano con los datos de muchos grupos de investigación, que van diciendo: Pues tenemos este gen que tendrá que ser esta secuencia del genoma y hemos encontrado estos 3 tránscriptos, y así poco a poco se van contando los genes.

Hay muchas zonas que si ves en el genoma pone "Hypothetical protein".

Es muchísimo más complicado ver dónde están los genes para los RNAs pequeños no codificantes, pero tb se basa en lo mismo.

#15 Esas son varias opciones, pero hay métodos bastante más elaborados, como el de Frederik Sanger, el cual se apoya en la tinción fluorescente de los diversos fragmenos de DNA y en la PCR.

En este enlace está relativamente bien explicado: http://es.wikipedia.org/wiki/Secuenciaci%C3%B3n_de_ADN

Me gustaría poder explicártelo mejor con mis palabras, pero aún me estoy formando, y las técnicas de secuenciación de DNA las he visto muy muy por encima y no las tengo claras

#16 Lo mío no es secuenciación, es anotación de genes (Ver dónde empiezan y terminan).

Para secuenciar genomas enteros no se usa el método de Sanger de todas formas.

#17 Como ya he dicho esto lo he tocado muy por encima y lo llevo más que verde. Molaría que me iluminaras a mi también

#18 Desde que se secuención el genoma (Método de Sanger, secuenciadores de primera generación) han salido muchos métodos nuevos (Secuenciadores de 2ª generación):
Pirosecuenciación (método 454): http://en.wikipedia.org/wiki/Pyrosequencing