El rector ha decidido enviar los resultados de la auditoria de este instituto a la Fiscalia para abrir una investigación. Es el segundo instituto en el que se han detectado irregularidades tras los hechos sucedidos con el extinto Instituto de Derecho Público, centro del escándalo de los másteres de Cristina Cifuentes, Pablo Casado y Carmen Montón. Es el Centro Integral de Formación Permanente y las irregularidades están relacionadas con el "incumplimiento de la normativa y control reiterado que pueden causar perjuicio económico a la URJC"..