Según datos publicados recientemente por varios profesores de la Universidad de Huelva, el embalse almacenará al año más de 70 toneladas de distintos metales pesados, procedentes de la cuenca minera del río Odiel; uno de los más contaminados del mundo. La calidad del agua no es apta para usos agrícolas y, debido a su alto contenido en manganeso, tampoco sirve para el riego por goteo, ya que lo taponaría este sistema de riego. Por otro lado, el embalse destruirá muy probablemente el paraje natural Las marismas del Odiel.