Sin embargo, en lugar reincorporarse a la Escuela Judicial para ser jueza, Sofía Marchena es ahora fiscal, dado que el órgano de gobierno de los jueces, el Consejo General del Poder Judicial (CGPJ) en una decisión inexplicable, ha cambiado su nota (de 68,20 a 52,31) sin dar ninguna explicación y ha asignado a Marchena una plaza de fiscal creada sólo para ella y que se suma a las 35 plazas ya creadas.